市场监管总局正组织修订《益生菌类保健食品注册审评指导原则》，增补修订了益生菌的定义，并同步修订了益生菌类保健食品的定义等，改革后对益生菌企业发展更增加保护，有望促进益生菌企业的发展。
相较2005年原国家食品药品监督管理局发布的《益生菌类保健食品申报与审评规定（试行）》，增补修订了以下内容：增加了益生菌的定义，并同步修订了益生菌类保健食品的定义；由于同一菌种不同菌株的安全和功效作用不完全一致，对用于保健食品的益生菌原料管理，由“菌种”水平提高到“菌株”水平；将保质期内活菌数目由不得少于106（10的6次方）CFU/mL（g）提高到不得少于107(10的7次方)CFU/mL（g），以保证产品在有效期内持续有效；明确了菌种鉴定机构的资质等。
此次增补修订，对益生菌菌种进行更新与益生菌国际通用分类学保持一致，便于公众检索查询。同时为了确保食用安全，国家卫生健康委将名单中部分菌种的表述具体到亚种。因为细菌的安全性和有效性具有菌株特异性，相同菌种的不同亚种和不同菌株，其安全性和有效性可能相差很大。区别到菌株，将使得行业更加规范，对国内益生菌企业发展有促进，?
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