了数据存储、计算、管理等多重技术支持，正是有了中间层的链接，超级计算机原理才能落实到应用问题解决之中。例：①使用并行程序进行密度泛函理论（DFT）计算已经成为材料科学、固体物理、计算化学、计算生物学等领域内必不可少的研究手段之一；
②并行实现的高精度耦合簇理论（CC）和组态相互作用（CI）方法被许多量子化学计算程序采用，成为计算化学的主要工具；
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